A Magyar Szója Nonprofit Kft. 2013. év októberében alakult és céljául tűzte ki a GMO mentes magyar szója értékláncban tevékenykedők érdekképviseletét. A közcélú nonprofit tevékenységekhez a kft. keretek korlátozott lehetőségeket biztosítottak, ezért jött létre később, 2016. évben a Magyar Szója és Fehérjenövény Egyesület. Az új szervezet létrejöttével sem szakadt meg azonban a munka a kft-nél, hiszen a nem szigorúan közcélú tevékenységek végzéséhez a gazdasági társasági forma biztosítja a megfelelő környezetet.
